NCBLab-Home

Laboratorium Komputasi Alami dan Bioinformatika (NCBLab)

Pengalaman

Minat Penelitian

1. Algoritma Bioinformatika
2. Kedokteran Presisi
3. Pertanian Cerdas
4. Analisis Big Data
5. Kecerdasan Buatan

Publikasi Terpilih

Jurnal (*Penulis Korespondensi):

1. Manuel Villa Jaimes, Siwahdol Chaimano, Sheng-Hsiang Lin, Yun-Hsuan Chang, Cheng-Ta Yang, Shulan Hsieh, Joshua Goh, Yen-Wei Chu, Meng-Che Tsai (2025) Hubungan antara kesulitan masa kanak-kanak, resiliensi, dan profil inflamasi pada dewasa muda Taiwan, Psychoneuroendocrinology, 107624.
2. Disline Manli Tantoh, Jen-Chieh Yu, Ching-Hsuan Chien, Wei-Yi Yeh dan Yen-Wei Chu* (2025) Ubigo-X: Prediksi Situs Ubiquitinasi Protein menggunakan Ensemble Learning dengan Representasi Fitur Berbasis Gambar dan Pemungutan Suara Terbobot, Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol. 27, Halaman 3137-3146. (SCI)
3. Tsung-Han Chou, Chi-Wei Chen, Su-Hua Huang, Ying-Tsong Chen dan Yen-Wei Chu* (2025) Prediksi cepat sensitivitas antibiotik pada Pseudomonas aeruginosa menggunakan spektroskopi UV-vis-NIR dan model one-vs-all kotak abu-abu, Journal of Microbiological Methods, 107179. (SCI)
4. Solange Mudih Ngala, Disline Manli Tantoh, Oswald Ndi Nfor, Gamo Djouomo Francis, Adeline Fitame dan Yen-Wei Chu* (2025) Hubungan spesifik usia antara Human Immunodeficiency Virus dan hasil pengobatan Tuberkulosis pada pasien Tuberkulosis di Wilayah Barat Kamerun, BMC Infectious Diseases, Vol. 25, 475. (SCI)
5. Chi-Hua Tung, Shih-Huan Lin, Kai-Po Chang, Ya-Wen Xu, Min-Ling Chuang dan Yen-Wei Chu* (2025) Light Bladder Net: Prediksi Kanker Kandung Kemih Non-Invasif dengan Pendekatan Deep Learning Berbobot dan Transformasi Data Grafis, Anticancer Research, 45 (5), 1953-1964. (SCI)
6. Cheng-Hsun Ho, Yen-Wei Chu, Lan-Ying Huang, dan Chi-Wei Chen (2025) SUMO-LMNet: Jaringan Pemetaan Tanpa Rugi untuk Memprediksi Situs SUMOilasi pada SUMO1 dan SUMO2 menggunakan Fitur Dimensi Tinggi, Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol. 27, Halaman 1048-1059. (SCI)
7. Hung-Ming Chiu, Shih-En Lin, Yen-Wei Chu*, Chih-Jung Chen (2025) Waikato Environment for Knowledge Analysis (WEKA) sebagai Metode Analisis Data yang Mengidentifikasi Parameter Hematologi Potensial untuk Diagnosis Dini Kanker Serviks, IN VIVO, 39: 1042-1053. (SCI)
8. Chi-Wei Chen, Wayne-Young Liu, Lan-Ying Huang dan Yen-Wei Chu* (2024) Menggunakan ensemble learning dan strategi hierarkis untuk memprediksi hasil ESWL untuk pengobatan batu ureter atas, Computers in Biology and Medicine, Volume 179, 2024, 108904. (SCI)
9. Yen-Wei Chu* dan Chang Chi-Chang (2023) Menggunakan Penanda Fisik & Genomik untuk Terapi Cerdas melalui Sistem Pakar dengan Pembelajaran Komputer, Frontiers in Genetics, 14:1336399. (SCI)
10. Shih-Huan Lin, Ching-Hsuan Chien, Kai-Po Chang, Min-Fang Lu, Yu-Ting Chen dan Yen-Wei Chu* (2023) SaBrcada: Prediksi Interval Kelangsungan Hidup untuk Pasien Kanker Payudara dengan Peningkatan Dimensi dan Stratifikasi Usia, Cancers, 15(14), 3690. (SCI)
11. Jie-Hao O, Chang-Hsin Ku, Yea-Fang Wu, Guo-Cih Lin, Miin-Huey Lee, RongKuen Chen, Hau-Ping Chou, Hsin-Yuh Wu, Sheng-Chi Chu, Qiao-Juan Lai, YiChen Tsai, Chun-Chi Lin, Chien-Chih Kuo, Chung-Ta Liao, Yi-Nian Chen, Yen-Wei Chu, Chi-Yu Chen (2023). Model deep learning berorientasi aplikasi untuk peringatan dini penyakit blas padi di Taiwan. Ecological Informatics. 73, 101950. (SCI)
12. Shu-Yuan Lin, Hui-Rong Su, Chen-Cheng Lo, Shang-Min Yeh, Chi-Hung Lee, Richard Wu, Fen-Chi Lin, Yen-Wei Chu*, Shuan-Yu Huang (2022) Efek Jarak Pandang yang Diperpanjang pada Respons Akomodatif dan Ukuran Pupil pada Orang Dewasa Miopia dengan Menggunakan Sistem Cermin Ganda, Int. J. Environ. Res. Public Health, 19(5), 2942. (SCI)
13. Ying-Hsuan Chen, Shun-Lung Chao dan Yen-Wei Chu* (2022) Efek Manfaat yang Dirasakan pada Niat Suplementasi Vitamin D: Perspektif Theory of Planned Behaviour, Int. J. Environ. Res. Public Health 19(4), 1952. (SCI)
14. Ching-Hsuan Chien, Lan-Ying Huang, Shuen-Fang Lo, Liang-Jwu Chen, Chi-Chou Liao, Jia-Jyun Chen dan Yen-Wei Chu* (2021) Menggunakan Pendekatan Machine Learning untuk Memprediksi Ekspresi Gen Target pada Mutan Insersi T-DNA Padi. Frontiers in Genetics,12, 798107-798107 (SCI)
15. Chi-Hua Tung, Yi-Sheng Chang, Kai-Po Chang dan Yen-Wei Chu* (2021) NIgPred: Prediksi Antibodi Spesifik Kelas untuk Epitop B-Sel Linear berdasarkan Fitur Heterogen dan Pendekatan Machine-Learning, Viruses, 13(8), 1531. (SCI)
16. Kai-Po Chang, Shih-Huan Lin,Yen-Wei Chu* (2021) Kecerdasan buatan dalam radiologi gastrointestinal: Tinjauan dengan fokus khusus pada perkembangan terbaru magnetic resonance dan computed tomography, Artificial Intelligence in Gastroenterology, 2(2): 27-41.
17. Chi-Wei Chen, Lan-Ying Huang, Chia-Feng Liao, Kai-Po Chang dan Yen-Wei Chu* (2020) GasPhos: Prediksi Situs Fosforilasi Protein menggunakan Pendekatan Seleksi Fitur Baru dengan Sistem Koloni Semut Berbantuan GA, International Journal of Molecular Sciences, 21(21):7891. (SCI)
18. Ching-Hsuan Chien, Chi-Chang Chang, Shih-Huan Lin, Chi-Wei Chen, Zong-Han Chang dan Yen-Wei Chu* (2020) N-GlycoGo: Memprediksi Situs N-glikosilasi Protein pada Dataset Tidak Seimbang dengan Menggunakan Strategi Heterogen dan Komprehensif, IEEE Access, doi:10.1109/ACCESS.2020.3022629. (SCI)
19. Kai-Po Chang, John Wang, Chi-Chang Chang,dan Yen-Wei Chu* (2020) Pengembangan Alat Baru untuk Pengambilan dan Analisis Karakteristik Ekspresi Reseptor Hormon pada Kanker Payudara Metastatik melalui Data Mining pada Laporan Patologi, BioMed Research International, 2020(7):2654815. (SCI)
20. Yen-Wei Chu, Ching-Hsuan Chien, Mei-I Sung, Chi-Wei Chen, dan Yu-Ting Chen (2020) dBMHCC: database biomarker Hepatocellular carcinoma (HCC) komprehensif menyediakan sistem prediksi yang andal untuk biomarker fosforilasi HCC baru, PLoS ONE, 15(6): e0234084. (SCI)
21. Chi-Hua Tung, Ching-Hsuan Chien, Chi-Wei Chen, Lan-Ying Huang, Yu-Nan Liu dan Yen-Wei Chu* (2020) QUATgo: Atribut struktur kuaterner protein diprediksi oleh pendekatan machine learning dua tahap dengan pengkodean fitur heterogen, PLoS ONE, 15(4): e0232087. (SCI)
22. Chi-Wei Chen, Meng-Han Lin, Chi-Chou Liao, Hsung-Pin Chang dan Yen-Wei Chu* (2020) iStable 2.0: Memprediksi perubahan stabilitas termal protein dengan mengintegrasikan berbagai modul karakteristik, Computational and Structural Biotechnology Journal, 18:622-630. (SCI: 6.018)
23. Yen-Wei Chu, Kai-Po Chang, Chi-Wei Chen, Yu-Tai Liang, Zhi Thong Soh dan Li‐Ching Hsieh* (2020) miRgo: mengintegrasikan berbagai alat siap pakai untuk identifikasi interaksi microRNA–target oleh fitur heterogen dan indikator evaluasi baru, Scientific Reports, 10:1466. (SCI)
24. Jehn-Hwa Kuo, Chi-Chang Chang, Chi-Wei Chen, Heng-Hao Liang, Chih-Yen Chang dan Yen-Wei Chu* (2020) Prediksi Epitop B-sel Struktural Berbasis Urutan dengan Menggunakan Model SVM Dua Lapis dan Fitur Aturan Asosiasi, Current Bioinformatics, 15(3), doi:10.2174/1574893614666181123155831 (SCI)
25. Jone-Han Liu, Chi-Chang Chang, Chi-Wei Chen, Li-Ting Wong dan Yen-Wei Chu* (2019) Penemuan wilayah konservasi untuk virus influenza A dengan metode machine learning dari situs glikosilasi terikat-N dan epitop B-sel, Mathematical Biosciences, 315:108217. (SCI)
26. Chi-Chou Liao, Liang-Jwu Chen, Shuen-Fang Lo, Chi-Wei Chen dan Yen-Wei Chu* (2019) EAT-Rice: Model prediktif untuk ekspresi gen flaking dari mutan padi yang diaktivasi oleh insersi T-DNA dengan pendekatan machine learning, PLoS Comput Biol, 15(5):e1006942. (SCI)
27. Kai-Po Chang,Yen-Wei Chu* dan John Wang (2019) Analisis Status Reseptor Hormon pada Kanker Payudara Primer dan Berulang Melalui Data Mining Laporan Patologi, Open Medicine, 20(14): 91-98. (SCI)
28. Yu-Ting Chen, Chi-Chang Chang, Chi-Wei Chen, Kuan-Chun Chen dan Yen-Wei Chu* (2019) Klasifikasi Gen MADS-Box pada Angiospermae dengan Pendekatan Clustering dan Machine Learning, Frontiers in Genetics, 8(9): 707. (SCI)
29. Chi-Wei Chen, Kai-Po Chang, Cheng-Wei Ho, Hsung-Pin Chang dan Yen-Wei Chu* (2018) KStable: Metode Komputasi untuk Memprediksi Perubahan Stabilitas Termal Protein dengan K-Star dan Seleksi Fitur Regular-mRMR, Entropy, 20(12): 988. (SCI)
30. Chi-Chang Chang,Chi-Hua Tung,Chi-Wei Chen,Chin-Hau Tu dan Yen-Wei Chu* (2018) SUMOgo: Prediksi situs sumoilasi pada lisin dengan model penyaringan motif dan efek berbagai modifikasi pasca-translasi. scientific report, 19;8(1):15512. doi: doi (SCI)
31. Quan Zou, Chi-Wei Chen, Hao-Chen Chang dan Yen-Wei Chu* (2018) Mengidentifikasi Situs Pembelahan Gelatinase A dan B dengan Mengintegrasikan Model Komputasi Fitur. Journal of Universal Computer Science, Vol. 24, No. 6, pp. 711-724 (SCI)
32. Chi-Chou Huang, Chi-Chang Chang, Chi-Wei Chen, Shao-yu Ho, Hsung-Pin Chang dan Yen-Wei Chu* (2018) PClass: Klasifikasi Struktur Kuaterner Protein dengan Menggunakan Strategi Bootstrapping sebagai Seleksi Model. Genes, Vol. 9, No. 2, pii: E91. doi: 10.3390/genes9020091 (SCI)
33. Chi-Wei Chen, Chi-Chang Chang, Hui-Chih Hung, Hsung-Pin Chang dan Yen-Wei Chu* (2018) Membangun Model Fitur untuk Prediksi Situs Sitrulinasi. Journal of Quality, Vol. 25, No. 3, doi:10.6220/joq.201806_25(3).0004 (EI)
34. Chi-Hua Tung, Pei-Wei Shueng,Yen-Wei Chu*, Chi-Wei Chen, Chian-Ying Chen (2017) Mengidentifikasi Crosstalk Modifikasi Pasca-Translasi untuk Kanker Payudara. Journal of Computing Science and Engineering, Vol. 11, No. 4, pp. 111-120 (EI)
35. Chi-Hua Tung, Chi-Wei Chen, Han-Hao Sun,Yen-Wei Chu* (2017) Memprediksi lokalisasi subselular protein manusia dengan pendekatan heterogen dan komprehensif, PLoS ONE, 12(6):e0178832. doi: 10.1371/journal.0178832 (SCI)
36. Chi-Hua Tung, Chi-Wei Chen, Ren-Chao Guo, Hui-Fuang Ng,Yen-Wei Chu* (2016) QuaBingo: Sistem Prediksi untuk Atribut Struktur Kuaterner Protein menggunakan Komposisi Blok, BioMed Research International, 2016:9480276, doi:10.1155/2016/9480276 (SCI: 2.134)
37. Han-Ju Chien+,Yen-Wei Chu+, Chi-Wei Chen, Yu-Min Juang, Min-Wei Chien, Chih-Wei Liu, Chia-Chang Wu, Jason T.C. Tzen dan Chien-Chen Lai* (2016) 2-DE dikombinasikan dengan seleksi fitur dua lapis secara akurat menentukan asal teh oolong, Food Chemistry, 211:392-9, doi:10.1016/jem.2016.05.043 (SCI: 6.306, Co-first Author)
38. Chi-Wei Chen, Jerome Lin,Yen-Wei Chu* (2013) iStable: Integrasi Prediktor Siap Pakai untuk Memprediksi Perubahan Stabilitas Protein, BMC Bioinformatics, 14(suppl 2):S5, doi:10.1186/1471-2105-14-S2-S5 (SCI: 2.435, ranking: 17.9%)
39. Wei-Jie Pan, Chi-Wei Chen, Heng-Hao Liang,Yen-Wei Chu* (2012) Memilih siRNA Efisiensi Tinggi dengan Model Komputasi, Advanced Science Letters, 18: 141-144. (SCI: 1.253, rank: 25%)
40. Chang-Hsien Yang, Yu-Yun Chang, Chi-Wei Chen, Min-Cheng Chan,Yen-Wei Chu* (2012) iMADS: Identifikasi Kelas Gen MADS-box pada Angiospermae, Advanced Science Letters, 18: 170-175. (SCI: 1.253, rank: 25%)
41. Po-Chang Chang, Wei-Jie Pan, Chi-Wei Chen,Yu-Ting Chen dan Yen-Wei Chu* (2012) DEsi: mesin desain siRNA yang mengintegrasikan prediksi SVM dan filter fitur, Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, doi: 10.1016/j.2012.01.005. (SCI:3.4，rank:28.7%)
42. Wei-Jie Pan, Chi-Wei Chen dan Yen-Wei Chu* (2011) siPRED: Memprediksi efikasi siRNA menggunakan berbagai metode karakteristik, PLoS ONE, doi: 10.1371/journal.0027602 (SCI: 3.057)
43. Yu-Yun Chang+,Yen-Wei Chu+, Chi-Wei Chen, Wei-Ming Leu, Hsing-Fun Hsu dan Chang-Hsien Yang* (2011) Karakterisasi Transkriptom Oncidium 'Gower Ramsey' menggunakan Pyrosequencing 454 GS-FLX dan Aplikasinya untuk Identifikasi Gen yang Terkait dengan Waktu Berbunga, Plant and Cell Physiology, 52(9): 1532-1545 (SCI: 4.319, Co-first Author)
44. Hui-Fuang Ng, Zeng-Wei Hong dan Yen-Wei Chu(2008) "Pose and Expression Invariant Face Recognition from a Single Training Sample Using Similarity Vector", Journal of Cybernetics and Systems, 1(1): 21-26. (International Journal)
45. Yen-Wei Chu* dan Chuen-Tsai Sun (2007) Problem-based Approach for Bioinformatics. International Journal of Instructional Media,Vol. 34 #4. (International Journal)
46. Yen-Wei Chu*, Chuen-Tsai Sun, dan Chung-Yuan Huang (2006) Regularity of Protein Secondary Structures and Its Prediction. WSEAS Transactions on Systems, 2(5), pp. 380-387. (EI).
47. Chung-Yuan Huang, Chuen-Tsai Sun, dan Yen-Wei Chu(2006) A Co-adaptive Approach to XCS Classifier Systems. WSEAS Transactions on Systems, 2(5), pp. 388-394. (EI)
48. Yen-Wei Chu* dan. Jinn-Moon Yang (2003) Finding Regularity in Various Types of Secondary Protein Structures, Journal of Information Science and Engineering, vol. 19, pp.943-952. (SCI)

Konferensi (*Pembicara Undangan):

1. Yueh-Yi Lee dan Yen-Wei Chu* (2025) Probabilitas aktivasi multi-jalur untuk prediksi imunotoksisitas PFAS menggunakan Weakly Supervised Learning, The 7th International Symposium on Engineering and Technology, Taichung, Taiwan.
2. Tzu-Chin Yang, Chun-Cheng Lee, Jen-I Hwang, Yu-Kang Chang, Pei-Jou Chen, Shih-Huan Lin, Yen-Wei Chu*(2025) Deteksi Tuberkulosis Berbasis Deep Learning dengan Strategi Fusi Gambar, The 6th International Conference on Engineering, Physics, MEMS-Biosensors and Applications, Taoyuan, Taiwan.
3. Lan-Ying Huang, Yen-Wei Chu*. (2025, October 10–12). Memprediksi ketahanan otak dari MRI struktural melalui ML yang dapat diinterpretasi. Paper dipresentasikan pada 2025 3rd International Symposium on Medical Decision Science (ISMDS 2025), Taipei, Taiwan. (Best Paper Award)
4. Disline Manli Tantoh, Yen-Wei Chu* (2025, October 10–12). Menggabungkan interaksi usia-HIV dalam analisis hasil pengobatan tuberkulosis untuk manajemen dan kebijakan perawatan kesehatan. Paper dipresentasikan pada 2025 3rd International Symposium on Medical Decision Science (ISMDS 2025), Taipei, Taiwan. (Best Paper Award)
5. Yen-Wei Chu* , Chi-Wei Chen, Lan-Ying Huang, Yun-Hsuan Chang (2025) Seleksi Fitur dan Optimasi Algoritma untuk Prediksi Usia Otak pada Pasien Skizofrenia, CINP-AsCNP 2025 Joint Congress, Melbourne, Australia.
6. Yueh Yi Lee dan Yen-Wei Chu* (2025) Menggunakan model prediksi koefisien penetrasi kulit dalam mencari kemungkinan pestisida berbahaya akibat paparan operator di Taiwan, 9th International Conference on Medical and Health Informatics, Kyoto, Japan. (Best Paper Award)
7. Sih-Han Chen, Gui-Chou Linag, Shu-Mei Dai dan Yen-Wei Chu* (2025) Deteksi Dini Kesehatan Tanaman Menggunakan Teknik Machine Learning, 9th International Conference on Medical and Health Informatics, Kyoto, Japan. (Best Paper Award)
8. Shih-Huan Lin, Min-Ling Chuang, Ya-Wen Xu dan Yen-Wei Chu* (2024) Sistem Prediksi Kanker Kandung Kemih Non-Invasif Ekstraksi Fitur Dalam, Proceedings of the 2024 8th International Conference on Medical and Health Informatics, Pages 219 - 223. (Best Paper Award)
9. Lan-Ying Huang, Han-Jung Hsiao, Zong-Zhun Lin, Chi-Wei Chen, Yen-Wei Chu* (2024) Menggunakan Pendekatan AI untuk Memprediksi Perubahan Penuaan Otak pada Skizofrenia, International Journal of Neuropsychopharmacology (CINP 2024), Vol. 28, pp.i80-i81. (SCI)
10. Yen-Wei Chu* (2024) Menggunakan Pendekatan Deep Learning Berpola untuk Prediksi Kanker Kandung Kemih, 2nd International Symposium on Medical Decision Science, Chiang Mai, Thailand.
11. Ching-Hsuan Chien, Li-Yun Tsai dan Yen-Wei Chu* (2024) Klasifikasi Berbasis Urutan Protein untuk Lima Jenis Demensia, 2nd International Symposium on Medical Decision Science, Chiang Mai, Thailand. (Best Paper Award)
12. Sih-Han Chen,Gui-Chou Liang, Lan-Ying Huang, Shih-Huan Lin, Shu-Mei Dai dan Yen-Wei Chu* (2023) Peringatan dini serangan serangga dengan kecerdasan buatan, Proceedings of 17th International Symposium on Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, pp. 111.
13. Chi-Wei Chen dan Yen-Wei Chu* (2023) Aplikasi kecerdasan buatan dalam budidaya padi dan identifikasi asal teh, Proceedings of 17th International Symposium on Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, pp. 56.
14. Chi-Wei Chen dan Yen-Wei Chu (2023) Menjelajahi Spesifisitas Substrat SUMO-1 dan SUMO-2 menggunakan Jaringan Syaraf Konvolusional, 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology, Japan.
15. Tian-Fu Lee, Yen-Wei Chu*, Wei-Jie Huang, Chun-Wei Hsu dan Zhi-Yang Chen (2023) Peningkatan Keamanan Skema Otentikasi untuk Layanan Kesehatan Cerdas, Proceedings of 2023 7th International Conference on Medical and Health Informatics, pp. 129–135.
16. Lan-Ying Huang, Chi-Wei Chen, Kai-Po Chang, Yen-Wei Chu* (2023) Membandingkan kinerja prediksi metode machine learning dan deep learning untuk situs pembelahan protease 3c-like, Proceedings of 2023 7th International Conference on Medical and Health Informatics, pp. 34–38. (Best Paper Award)
17. Tsung Han Chou, Su Hua Huang dan Yen Wei Chu* (2023) Mengurangi Waktu untuk Mengidentifikasi Bakteri Resisten Obat yang Disebabkan oleh Infeksi Aliran Darah Melalui Machine Learning dan Spektroskopi UV-Vis, 2023 6th International Conference on Healthcare Service Management, Japan.
18. Chi-Wei Chen, Meng-Han Lin, Hsung-Pin Chang dan Yen-Wei Chu (2020) Peningkatan Prediksi Stabilitas Protein dengan Pendekatan Komputasi Terintegrasi, 2020 10th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics, pp. 8-13.
19. Shih-Huan Lin, Liang-Yu Hsia, Chen-Hua Liu dan Yen-Wei Chu (2019) Menggunakan Pendekatan Kecerdasan Buatan untuk Memprediksi Risiko Dekompensasi Hati yang Diinduksi oleh Prod, ANIMH 2nd International Conference on Modern Trends in Engineering, Applied Sciences, IT and Communication Technologies, Hong Kong.
20. Yu-Tai Laing, Chun-Chieh Chen, Shuen-Fang Lo, Tuan-Hua David Ho, Su-May Yu dan Yen-Wei Chu (2019) Menggunakan Pendekatan Kecerdasan Buatan untuk Mengembangkan Sistem Irigasi Cerdas untuk Tanaman, ANIMH 2nd International Conference on Modern Trends in Engineering, Applied Sciences, IT and Communication Technologies, Hong Kong.
21. Chi-Wei Chen, Chin-Hau Tu dan Yen-Wei Chu (2018) Prediksi Situs SUMOilasi dengan Pendekatan Machine Learning, IEEE International Conference on Consumer Electronics-Taiwan.
22. Kai-Po Chang, Chi-Chang Chang,Yen-Wei Chu dan John Wang (2018) BreastExtractor: Program Text Mining Berbasis Pencocokan Kata/Frasa untuk Ekstraksi Otomatis Data Reseptor Hormon dari Laporan Patologi Teks Bebas pada Kanker Payudara, the second International Conference on Medical and Health Informatics. (Best Paper Award)
23. Kai-Po Chang, John Wang dan Yen-Wei Chu (2016) Big data di kantor patolog: ekstraksi dan analisis skala besar hasil studi imunohistokimia dalam laporan patologi teks bebas oleh skrip Python sisi klien, Paper dipresentasikan pada 2016 Annual Meeting of Taiwan Society Of Pathology, Taipei, Taiwan.
24. Ci-Jhou Liao, Liang-Jwu Chen,Yen-Wei Chu (2014) Menggunakan pendekatan machine learning untuk memprediksi ekspresi gen flaking pada garis padi yang diaktivasi insersi T-DNA, Summer Workshop on Plant Molecular Biology, Nantou County, Taiwan, July 4-6.
25. Chi-Wei Chen, Hui-Chih Hung,Yen-Wei Chu (2014) Prediksi Situs Sitrulinasi dengan Pendekatan Machine Learning, Proceedings of the 25th International Conference on Information Management (ICIM 2014), pp. 1-13. (Best Paper Award)
26. Chi-Wei Chen, Hui-Chih Hung,Yen-Wei Chu (2013) Integrasi Model Fitur oleh Komputasi Evolusioner untuk Memprediksi Situs Sitrulinasi Protein, Proceedings of the Taiwan Academic Network Conference 2013 (TANet 2013), pp. 1047-1052.
27. Hao-Chen Chang dan Yen-Wei Chu (2013) Prediksi Situs Pembelahan Substrat Gelatinase Menggunakan Machine Learning dan Seleksi Fitur, Proceedings of the Taiwan Academic Network Conference 2013 (TANet 2013), pp. 1053-1058.
28. Chi-Wei Chen, Jerome Lin,Yen-Wei Chu* (2013) iStable: Integrasi Prediktor Siap Pakai untuk Memprediksi Perubahan Stabilitas Protein, The Eleventh Asia Pacific Bioinformatics Conference, Vancouver, BC, Canada, January 21-23.
29. Wen-Pin Hu, Chi-Wei Chen, Jian-Shiun Chen, dan Yen-Wei Chu* (2012) Mengevaluasi berbagai pendekatan machine learning untuk prediksi jumlah bintik matahari. Symposium of university league in Changhua, Yunlin, and Chiayi, Taiwan, December 7.
30. Yu-Yun Chang,Yen-Wei Chu, Wei-Ming Leu dan Chang-Hsien Yang (2011) Karakterisasi transkriptom Oncidium 'Gower Ramsey' untuk menggunakan pirosekuensing GS-FLX 454 dan aplikasinya untuk studi gen terkait waktu berbunga. The International Conference Plant Gene Discovery Technologies. Venue. February 23- 26.
31. Yu-Yun Chang,Yen-Wei Chu, Hsing-Fun Hsu, Chi-Wei Chen, Wei-Ming Leu dan Chang-Hsien Yang (2011) Karakterisasi transkriptom Oncidium 'Gower Ramsey' menggunakan pirosekuensing 454 GS-FLX dan aplikasinya untuk identifikasi gen yang terkait dengan waktu berbunga. 2011 Canadian Plant Genomics Workshop, Niagara Falls, Ontario. Canada, August 22-25.
32. Wei-Jie Pan, Chi-Wei Chen dan Yen-Wei Chu* (2011) Seleksi siRNA efikasi tinggi menggunakan pendekatan machine learning, Proceedings of 2011 Joint Conference on 7th Taiwan Software Engineering (TCSE) and 22nd Object-Oriented Technology and Applications (OOTA), pp. 94-99
33. Qiu-Hui Lin, Chi-Wei Chen, Zeng-Wei Hong*, dan Yen-Wei Chu* (2009) PredPhosGrid - Sistem Prediksi Fosforilasi Berbasis Grid dengan Rekayasa Ulang Situs Web Bioinformatik Siap Pakai, Proceedings of the 20th Workshop on Object-Oriented Technology and Applications, pp. 1-6.
34. Cheng-Yu Liao, Wei-Fu Lu dan Yen-Wei Chu* (2009) Menggunakan Algoritma Genetika untuk Membantu Klasifikasi Dokumen Biologi: Contoh Data Jamur dan Cendawan, Information Management and Commerce Technology Conference, pp. 559, Yunlin, Taiwan.
35. Yen-Wei Chu*, Chin-Sheng Yu. dan Hui-Fuang Ng. (2008) Prediksi Struktur Sekunder Protein Menggunakan Pendekatan Fusi Data, Proceedings of the 7th IEEE World Congress on Intelligent Control and Automation (WCICA), v. 4, pp. 1885-1890. (EI, NSC 96-2218-E-468-001)
36. Hui-Fuang Ng* dan Yen-Wei Chu (2008) Model Warna Invarian Pencahayaan untuk Pencocokan Gambar dan Pengenalan Objek, The Eighth International Conference on Intelligent Systems Design and Applications. (EI)
37. Yen-Wei Chu*, Chin-Sheng Yu., Chia-Hsiang Pai dan You-Ting Wu (2007) Prediksi Situs Fosforilasi Protein Menggunakan Pendekatan Fusi Data, National Computer Symposium, v1, pp. 1-8 (NSC 96-2218-E-468-001)
38. Yen-Wei Chu*, Chin-Sheng Yu., Chih-Ying Chen dan Kun-Chang Hsieh (2007) Menerapkan Strategi Konservasi Urutan untuk Memprediksi Situs Fosforilasi Protein, National Computer Symposium, v1, pp.9-15 (NSC 96-2218-E-468-001)
39. Ting-Yi Chang*, Yi-Ting Chen, dan Yen-Wei Chu (2007) 'Mengembangkan Penilaian Teman Sejawat Pembelajaran Kooperatif dalam e-Learning — Menggunakan Consistent Fuzzy Preference Relation, National Computer Symposium, pp. 554-561
40. Hui-Fuang Ng*, Ding-Fu Wang dan Yen-Wei Chu (2007) Deskriptor warna invarian pencahayaan untuk pencocokan gambar. The 20th IPPR Conference on Computer Vision, Graphics and Image Processing, Miaoli, Taiwan.
41. Yen-Wei Chu* dan Chuen-Tsai Sun (2006) Pendekatan Hybrid Genetic Algorithm untuk Struktur Sekunder Protein, Proceedings of the 6th IEEE World Congress on Intelligent Control and Automation (WCICA), v. 4, pp. 3320-3324. (EI)
42. Yen-Wei Chu*, Chuen-Tsai Sun, dan Chung-Yuan Huang (2005) Menemukan Keteraturan dalam Struktur Sekunder Protein menggunakan Algoritma Genetika Berbasis Cluster. In Proceedings of International Conference on Computational Intelligence, Man-Machine Systems and Cybernetics (CIMMACS'05), Miami, Florida, USA, pp. 179-183. (IEE, EI)
43. Chung-Yuan Huang*, Chuen-Tsai Sun, dan Yen-Wei Chu (2005) Menggunakan Mekanisme Koevolusi dengan Arsitektur Dyna untuk Adaptasi Parameter dalam Sistem Klasifikasi XCS. In Proceedings of International Conference on Computational Intelligence, Man-Machine Systems and Cybernetics (CIMMACS'05), Miami, Florida, USA, pp. 173-178. (IEE, EI)
44. Yen-Wei Chu* dan Chuen-Tsai Sun (2004) Keteraturan struktur protein sekunder: Pendekatan algoritma genetika, Proceedings of the 5th IEEE World Congress on Intelligent Control and Automation (WCICA), v. 3, pp. 2104-2108. (EI)
45. Chuen-Tsai* Sun dan Yen-Wei Chu (1997) Perilaku Histeresis dalam Persepsi Fuzzy: Eksperimen Awal. Second International ICSC Symposium on Intelligent Industrial Automation and Soft Computing, Nimes, France, Sep. 1997.

Buku

1. Chu Yen-Wei dkk. (2024) Kedokteran Cerdas - Eksplorasi Studi Kasus Model Aplikasi Data Kesehatan Besar/Pusat Promosi Kedokteran Presisi Universitas Nasional Taiwan
2. Chu Yen-Wei dkk. (2024) Pertanian Berkelanjutan di Bawah Tantangan Perubahan Iklim: Strategi Efektif untuk Meningkatkan Kualitas dan Kuantitas Pangan/Bulanan Sains
3. Chu Yen-Wei dkk. (2023) Praktik Aplikasi Teknologi Kecerdasan Buatan di Pertanian/Pusat Pengajaran Promosi Pertanian Presisi Universitas Chung Hsing
4. Chu Yen-Wei dkk. (2022) Kedokteran Cerdas - Data Kesehatan Besar/Pusat Promosi Kedokteran Presisi Universitas Nasional Taiwan
5. Chu Y.W. (2006) Menemukan Keteraturan Struktur Sekunder Protein dan Aplikasi Terkait: Universitas Nasional Chiao Tung, Hsinchu, Taiwan. (Disertasi)
6. Chu Y.W. (1998) Studi tentang Histeresis: Persepsi Manusia dan Prediksi Deret Waktu: Universitas Nasional Chiao Tung, Hsinchu, Taiwan. (Tesis Magister)

Paten

1. Chu Yen-Wei dkk. (2025) Penemuan_Metode Peringatan Dini Penyakit Nematoda Padi dan Sistem Peringatan Dini (Nomor Paten: I891590)
2. Chu Yen-Wei dkk. (2024) Penemuan_Sistem Peringatan Dini Kekeringan Tanaman dengan Pencitraan Multispektral Simulasi RGB (Nomor Paten: I866508)
3. Chu Yen-Wei dkk. (2024) Penemuan_Metode untuk Meningkatkan Kandungan Mikronutrien dalam Tanaman Pangan (Nomor Paten: I861639)
4. Chu Yen-Wei dkk. (2024) Penemuan_Sistem dan Metode Peringatan Dini Penyakit Blas Padi (Nomor Paten: I831034)
5. Chu Yen-Wei dkk. (2023) Penemuan_Sistem dan Metode untuk Memprediksi Kebutuhan Air Padi (Nomor Paten: I821719)
6. Chu Yen-Wei dkk. (2023) Inovasi_Sistem Identifikasi Kecap (Nomor Paten: M646122)
7. Chu Yen-Wei dkk. (2023) Penemuan_Sistem dan Metode Prediksi Efisiensi Produksi Susu Sapi Laktasi (Nomor Paten: I792388)
8. Chu Yen-Wei dkk. (2022) Penemuan_Sistem dan Metode Peringatan Dini Kesehatan Hama Padi (Nomor Paten: I765794)
9. Chu Yen-Wei dkk. (2022) Penemuan_Metode Identifikasi Madu dan Sistem Identifikasi Madu (Nomor Paten: I760820)
10. Chu Yen-Wei dkk. (2019) Penemuan_Metode untuk Membedakan Teh dari Batch Berbeda dan Sistem Identifikasinya (Nomor Paten: I662279)

Penghargaan