Studi In Silico Glibenclamide sebagai Kandidat Obat Antikanker pada Inhibitor MAP2K1 dengan Metode Reverse Docking

Studi In Silico Glibenclamide sebagai Kandidat Obat Antikanker pada Inhibitor MAP2K1 dengan Metode Reverse Docking

Ahmad Gasya Afiansyah, Rudy Mardianto, Novyananda Salmasfattah

Institut Teknologi, Sains, dan Kesehatan RS DR. Soepraoen

Abstrak

Tingkat keparahan efek samping dari obat antikanker yang ada di pasaran saat ini termasuk efek samping yang berpotensi fatal seperti kardiotoksisitas pada kasus doksorubisin. Penelitian ini bertujuan untuk menemukan kandidat obat antikanker baru yang memiliki efek samping rendah. Desain penelitian yang digunakan adalah penelitian eksperimental laboratorium kering dengan metode in silico, yang dilakukan pada Agustus 2023 di Laboratorium Kimia Institut Teknologi, Sains, dan Kesehatan RSUD dr. Soepraoen. Pendekatan in silico merupakan metode komputasi untuk menemukan kandidat obat baru. Ligan glibenklamid dan doksorubisin diperoleh dari basis data PubChem, dan protein target MAP2K1, yang diperoleh dari basis data SwissModel, berfungsi sebagai reseptor. Dalam penelitian ini, ligan dan protein dipersiapkan menggunakan perangkat PyMOL, dan hasil penambatan yang diperoleh dari perangkat PyRx adalah nilai afinitas pengikatan. Afinitas pengikatan antara protein dengan glibenklamid dan doksorubisin masing-masing adalah -9,9 kkal/mol dan -8,8 kkal/mol, hasil penambatan divisualisasikan menggunakan PyMOL. Senyawa glibenklamid terikat kurang erat dibandingkan yang terikat dengan doksorubisin, tetapi masih berinteraksi kuat dengan protein MAP2K1; PLIP (Protein-Ligand Interaction Profiler) dapat digunakan untuk memvisualisasikan efek interaksi ini. Menurut temuan penelitian, senyawa glibenklamid memiliki interaksi yang baik dengan protein MAP2K1, yang dapat menjadikannya target yang menjanjikan untuk obat kanker di masa depan. In silico adalah langkah pertama dalam penemuan obat baru, sehingga untuk memvalidasi temuan ini, diperlukan penelitian lebih lanjut secara biokimia, in vitro, dan in vivo.

Kata Kunci

Kanker, Glibenklamid, In Silico, MAP2K1

Referensi

1. WHO. Diterbitkan 20 April 2023. Diakses 20 April 2023.
2. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, dkk. Statistik Kanker Global 2020: Perkiraan GLOBOCAN tentang Insidensi dan Mortalitas di Seluruh Dunia untuk 36 Kanker di 185 Negara. CA Cancer J Clin. 2021;71(3):209-249. doi:10.3322/caac.21660
3. Rawat PS, Jaiswal A, Khurana A, Bhatti JS, Navik U. Kardiotoksisitas yang Diinduksi Doksorubisin: Pembaruan tentang Mekanisme Molekuler dan Strategi Terapi Baru untuk Penanganan Efektif. Biomedicine and Pharmacotherapy. 2021;139:111708. doi:10.1016/j.2021.111708
4. Sebayang ANO. Efek Kardiotoksik Obat Kemoterapi Doxorubicin. JIMKI: Jurnal Ilmiah Mahasiswa Kedokteran Indonesia. 2021;7(1):1-5. doi:10.53366/jimki.v7i1.387
5. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, dkk. Statistik Kanker Global 2020: Perkiraan GLOBOCAN tentang Insidensi dan Mortalitas di Seluruh Dunia untuk 36 Kanker di 185 Negara. CA Cancer J Clin. 2021;71(3):209-249. doi:10.3322/caac.21660
6. Siddiqui M, Rajkumar SV. Biaya Tinggi Obat Kanker dan Apa yang Dapat Kita Lakukan. Mayo Clin Proc. 2017;87(10):935-943. doi:10.1016/j.2012.07.007
7. Li X, Zhang XX, Lin YX, Xu XM, Li L, Yang JB. Penapisan Virtual Berdasarkan Ensemble Docking yang Menargetkan p53 Tipe Liar untuk Penemuan Obat Antikanker. Chem Biodivers. 2019;16(7). doi:10.1002/cbdv.201900170
8. Subramaniyam N, Arumugam S, Ezthupurakkal PB, dkk. Mengungkap Potensi Antikanker Glibenklamid: Sinergi Sitotoksisitasnya dengan Doksorubisin pada Sel Kanker. J Pharm Biomed Anal. 2018;154:294-301. doi:10.1016/j.2018.03.025
9. KEGG pathway. Diterbitkan 2023.
10. Soleimani A, Rahmani F, Saeedi N, dkk. Peran Potensial MikroRNA Regulator Jalur Sinyal RAS/MAPK dalam Patogenesis Kanker Kolorektal. J Cell Biochem. 2019;120(12):19245-19253. doi:10.1002/jcb.29268
11. Hashemzadeh S, Ramezani F, Rafii-Tabar H. Studi Mekanisme Molekuler Interaksi antara MEK1/2 dan Trametinib dengan Penambatan dan Simulasi Dinamika Molekuler. Interdiscip Sci. 2019;11(1):115-124. doi:10.1007/s12539-018-0305-4
12. Rezatabar S, Karimian A, Rameshknia V, dkk. Fungsi Sinyal RAS/MAPK dalam Stres Oksidatif, Respons Kerusakan DNA, dan Perkembangan Kanker. J Cell Physiol. 2019;234(9):14951-14965. doi:10.1002/jcp.28334
13. Salmasfattah N, Nurulita NA, Dhiani BA. Penapisan Virtual pada Molekul yang Menargetkan Interaksi antara Reseptor Estrogen Beta dan Murine Double Minute 2. Indonesian Journal of Cancer Chemoprevention. 2023;13(3):184. doi:10.14499/indonesianjcanchemoprev13iss3pp184-194
14. Dhiani BA, Nurulita NA, Fitriyani F. Studi Penambatan Protein-protein Interaksi Reseptor Estrogen Alfa dan TRIM56 untuk Penapisan Obat Kanker Payudara. Indonesian Journal of Cancer Chemoprevention. 2022;13(1):46. doi:10.14499/indonesianjcanchemoprev13iss1pp46-54
15. Dona R, Frimayanti N, Ikhtiarudin I, Iskandar B, Maulana F, Silalahi NT. Studi In Silico, Sintesis, dan Uji Sitotoksik Senyawa P-Metoksi Kalkon terhadap Sel Kanker Payudara MCF-7. Jurnal Sains Farmasi & Klinis. 2019;6(3):243. doi:10.25077/jsfk.6.3.243-249.2019
16. Jean-Quartier C, Jeanquartier F, Jurisica I, Holzinger A. Riset Kanker In Silico menuju 3R. BMC Cancer. 2018;18(1):1-12. doi:10.1186/s12885-018-4302-0
17. Shaker B, Ahmad S, Lee J, Jung C, Na D. Metode dan Alat In Silico untuk Penemuan Obat. Comput Biol Med. 2021;137:104851. doi:doi
18. Tao X, Huang Y, Wang C, dkk. Perkembangan Terkini Teknologi Penambatan Molekuler yang Diterapkan dalam Ilmu Pangan: Sebuah Tinjauan. Int J Food Sci Technol. 2020;55(1):33-45. doi:10.1111/ijfs.14325
19. Xu J, Rajaratnam R. Keamanan Kardiovaskular Farmakoterapi Non-Insulin untuk Diabetes Tipe 2. Cardiovasc Diabetol. 2017;16(1):1-12. doi:10.1186/s12933-017-0499-5
20. Dias R, de Azevedo Jr. W. Algoritma Penambatan Molekuler. Curr Drug Targets. 2008;9(12):1040-1047. doi:10.2174/138945008786949432
21. Rezatabar S, Karimian A, Rameshknia V, dkk. Fungsi Sinyal RAS/MAPK dalam Stres Oksidatif, Respons Kerusakan DNA, dan Perkembangan Kanker. J Cell Physiol. 2019;234(9):14951-14965. doi:10.1002/jcp.28334
22. Soleimani A, Rahmani F, Saeedi N, dkk. Peran Potensial MikroRNA Regulator Jalur Sinyal RAS/MAPK dalam Patogenesis Kanker Kolorektal. J Cell Biochem. 2019;120(12):19245-19253. doi:10.1002/jcb.29268
23. Hashemzadeh S, Ramezani F, Rafii-Tabar H. Studi Mekanisme Molekuler Interaksi antara MEK1/2 dan Trametinib dengan Penambatan dan Simulasi Dinamika Molekuler. Interdiscip Sci. 2019;11(1):115-124. doi:10.1007/s12539-018-0305-4
24. Samatar AA, Poulikakos PI. Menargetkan Sinyal RAS-ERK dalam Kanker: Janji dan Tantangan. Nat Rev Drug Discov. 2014;13(12):928-942. doi:10.1038/nrd4281
25. Pratama NAL, Meilani A, Fakih TM. Studi In Silico Senyawa Turunan Kurkuminoid terhadap Reseptor Androgen sebagai Kandidat Terapi Kanker Prostat. Jurnal Ilmiah Farmasi Farmasyifa. 2021;4(2):29-38. doi:10.29313/jiff.v4i2.7783
26. Arwansyah A, Ambarsari L, Sumaryada TI. Simulasi Penambatan Senyawa Kurkumin dan Analognya sebagai Inhibitor Reseptor Androgen pada Kanker Prostat. Current Biochemistry. 2014;1(1):11-19. doi:10.29244/cb.1.1.11-19