Bet v I/Major latex protein (IPR000916) - InterPro entry

Bet v I/Major latex protein (IPR000916)

Entri InterPro

Deskripsi

Domain ini dinamai berdasarkan Bet v 1, alergen serbuk sari birch utama. Bet v 1 termasuk dalam famili 10 protein terkait patogenesis tanaman (PR-10), protein sitoplasma dengan berat 15-17 kD yang tersebar luas di antara tanaman dikotil [2]. Dalam beberapa tahun terakhir, sejumlah protein tanaman yang beragam dengan kesamaan sekuens rendah terhadap Bet v 1 telah diidentifikasi. Klasifikasi berdasarkan kesamaan sekuens menghasilkan beberapa subfamili yang terkait dengan PR-10 [1]:

Protein terkait patogenesis PR-10: Protein ini diidentifikasi sebagai alergen serbuk sari pohon utama pada birch dan spesies terkait (hazel, alder), sebagai alergen makanan nabati yang diekspresikan pada tingkat tinggi dalam buah-buahan, sayuran, dan biji-bijian (apel, seledri, hazelnut), dan sebagai protein terkait patogenesis yang ekspresinya diinduksi oleh infeksi patogen, luka, atau stres abiotik. Hyp-1 (Q8H1L1), enzim yang terlibat dalam sintesis hiperisin naptodianthron bioaktif pada tanaman St. John's wort (Hypericum perforatum) juga termasuk dalam famili ini. Sebagian besar protein ini ditemukan pada tanaman dikotil. Selain itu, sekuens terkait diidentifikasi pada monokotil dan konifer.
Protein pengikat khusus sitokinin: Protein kacang-kacangan ini mengikat hormon tanaman sitokinin [4].
Sintase (S)-norkoklaurin adalah enzim yang mengkatalisis kondensasi dopamin dan 4-hidroksifenilasetaldehida menjadi (S)-norkoklaurin, langkah pertama yang berkomitmen dalam biosintesis alkaloid benzilisoquinolin seperti morfin [3].
Protein lateks utama dan protein terkait pematangan adalah protein dengan fungsi biologis yang tidak diketahui yang pertama kali ditemukan dalam lateks opium poppy (Papaver somniferum) dan kemudian ditemukan mengalami regulasi naik selama pematangan buah seperti stroberi dan mentimun [3].

Keberadaan protein terkait Bet v 1 terbatas pada tanaman biji, dengan pengecualian protein pengikat sitokinin dari lumut Physcomitrella patens (Q9AXI3).

Referensi

1. Lipatan Bet v 1: kerangka kuno dan serbaguna untuk pengikatan ligan hidrofobik besar. BMC Evol. Biol. 8, 286, (2008). DOI: 10.1186/1471-2148-8-286 PMID: 18922149

2. Potensi homolog Betv1, keluarga multigen inti, sebagai penanda filogenetik pada tanaman berbunga. Wen J, Vanek-Krebitz M, Hoffmann-Sommergruber K, Scheiner O, Breiteneder H. Mol. Phylogenet. Evol. 8, 317-33, (1997). DOI: 10.1006/mpev.1997.0447 PMID: 9417891

3. Kloning molekuler dan karakterisasi sintase norkoklaurin, enzim yang mengkatalisis langkah pertama yang berkomitmen dalam biosintesis alkaloid benzilisoquinolin. Samanani N, Liscombe DK, Facchini PJ. Plant J. 40, 302-13, (2004). DOI: 10.1111/j.1365-313X.2004.02210.x PMID: 15447655

4. Purifikasi dan kloning cDNA protein pengikat khusus sitokinin dari kacang hijau (Vigna radiata). Fujimoto Y, Nagata R, Fukasawa H, Yano K, Azuma M, Iida A, Sugimoto S, Shudo K, Hashimoto Y. Eur. J. Biochem. 258, 794-802, (1998). DOI: 10.1046/j.1432-1327.1998.2580794.x PMID: 9874249